1955年 熊澤義宣伝道師(当時)が下町の開拓伝道を志し、富岡町の集会所を借りて第一回目の礼拝を行う
1956年 白河町の借間を経て、現在地(当時は深川平久町)に民家を購入。 礼拝、日曜学校、祈祷会を開始する
1957年 塩崎町(のち塩浜)に教会学校分校を開設。
後に子供会、補習塾と発展した(1998年まで)
1958年 近藤(のち高倉)田鶴子牧師就任。熊澤牧師をドイツ留学に送り出す
1961年 高倉謙次牧師就任(高倉牧師夫妻在任は1975年まで)
1963年 深川伝道所から深川教会となる
1964年 隣家を購入し、別館として集会室、牧師館、教会員住宅に活用
1976年 戒能信生牧師就任(1997年まで)
1984年 深川教会の墓地を千葉県習志野市に設置
1991年 会堂、牧師館の増 改築を行い、一つの建物として整備された
1997年 三田旅人牧師・木原葉子牧師就任(2005年まで)
2005年 板垣弘毅牧師就任(2013年まで)
2013年 長尾邦弘牧師就任(2023年3月まで)
2016年 礼拝堂改修を行い構造補強とバリアフリー化を実施
2023年 友野富美子牧師就任